Sådan Beregn det isoelektriske punkt for peptider

March 8

Peptider er korte polymerfragmenter sammensat af aminosyrer. Hvert peptid har en vis aminosyresekvens betegnet med tre bogstaver eller ét bogstav kode; for eksempel aminosyren alanin forkortet som "Ala" eller "A" ladningen af peptider i opløsning afhænger af opløsningen surhedsgrad. Det isoelektriske punkt (pi) henviser til opløsningen syreindhold værdi, ved hvilken peptidet molekyle har nettoladning nul. Opløseligheden af peptidet er minimal ved det isoelektriske punkt. Brug tilgængelige webservere at beregne pi værdi for et peptid aminosyresekvens.

Vejledning

• Skriv peptidsekvensen ved hjælp af etbogstavskoden. For eksempel, hvis et peptid har en aminosyresekvens Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (alanin-Serin-Glumatic acid-leucin-prolin), så et bogstav sekvens er "ASELP." Hvis det er nødvendigt høre tre bogstaver til et bogstav omregningstabel givet i Ressourcer.

• Brug en webbrowser, Internet Explorer eller Firefox, for eksempel, for at navigere til en server, der beregner peptidet isoelektriske punkt (pi) se Resources.

• Indtast peptid én bogstaver sekvens- "ASELP" i vores eksempel-i boksen, og klik på "Beregn".

4. Læs det isoelektriske punkt (pi) værdi i linjen "Teoretisk pi / MW." I vores eksempel, pi er 4,00. Bemærk serveren beregner også molekylvægt (Mw) af peptidet.